Bir uçak esrarengiz bir virüs tarafından teslim alınır. Uçak indiğinde ise karantina altına alınır. Sağ kalan yolcular karantinadan kurtulabilmek için birlikte hareket etmek zorundadırlar. İlk film (Karantina) hatırlayacağınız gibi İspanya yapımı REC'in yeniden çevrimiydi. Fakat Karantina 2'nin REC 2 ile bir bağlantısı yok...